MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori OK310 DNA

Total Repeats: 33270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020509	CATT	2	8	114	121	25 %	50 %	0 %	25 %	478429023
2	NC_020509	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429023
3	NC_020509	TG	3	6	138	143	0 %	50 %	50 %	0 %	478429023
4	NC_020509	T	6	6	259	264	0 %	100 %	0 %	0 %	478429023
5	NC_020509	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429023
6	NC_020509	T	7	7	318	324	0 %	100 %	0 %	0 %	478429023
7	NC_020509	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	478429023
8	NC_020509	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429023
9	NC_020509	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429023
10	NC_020509	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429023
11	NC_020509	C	6	6	400	405	0 %	0 %	0 %	100 %	478429023
12	NC_020509	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429024
13	NC_020509	C	6	6	642	647	0 %	0 %	0 %	100 %	478429024
14	NC_020509	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429024
15	NC_020509	CT	3	6	703	708	0 %	50 %	0 %	50 %	478429024
16	NC_020509	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429024
17	NC_020509	TCTG	2	8	810	817	0 %	50 %	25 %	25 %	478429024
18	NC_020509	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429024
19	NC_020509	TTGCAA	2	12	867	878	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	478429024
20	NC_020509	AAAT	2	8	912	919	75 %	25 %	0 %	0 %	478429025
21	NC_020509	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429025
22	NC_020509	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429025
23	NC_020509	CCGCAG	2	12	1043	1054	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	478429025
24	NC_020509	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429025
25	NC_020509	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429025
26	NC_020509	CA	3	6	1226	1231	50 %	0 %	0 %	50 %	478429025
27	NC_020509	T	6	6	1243	1248	0 %	100 %	0 %	0 %	478429025
28	NC_020509	TC	3	6	1285	1290	0 %	50 %	0 %	50 %	478429025
29	NC_020509	T	6	6	1347	1352	0 %	100 %	0 %	0 %	478429025
30	NC_020509	ACTC	2	8	1377	1384	25 %	25 %	0 %	50 %	478429025
31	NC_020509	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478429025
32	NC_020509	GCT	2	6	1447	1452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429025
33	NC_020509	CT	3	6	1561	1566	0 %	50 %	0 %	50 %	478429025
34	NC_020509	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	478429025
35	NC_020509	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429025
36	NC_020509	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429025
37	NC_020509	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429026
38	NC_020509	A	7	7	1777	1783	100 %	0 %	0 %	0 %	478429026
39	NC_020509	ATTATA	2	12	1795	1806	50 %	50 %	0 %	0 %	478429026
40	NC_020509	CCTG	2	8	1810	1817	0 %	25 %	25 %	50 %	478429026
41	NC_020509	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429026
42	NC_020509	CCAA	2	8	1834	1841	50 %	0 %	0 %	50 %	478429026
43	NC_020509	TGAA	2	8	1874	1881	50 %	25 %	25 %	0 %	478429026
44	NC_020509	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429026
45	NC_020509	T	6	6	1976	1981	0 %	100 %	0 %	0 %	478429026
46	NC_020509	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429026
47	NC_020509	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429026
48	NC_020509	CAT	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429026
49	NC_020509	AATG	2	8	2064	2071	50 %	25 %	25 %	0 %	478429026
50	NC_020509	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429026
51	NC_020509	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429026
52	NC_020509	G	6	6	2189	2194	0 %	0 %	100 %	0 %	478429026
53	NC_020509	ATTC	2	8	2349	2356	25 %	50 %	0 %	25 %	478429026
54	NC_020509	TTTGT	2	10	2424	2433	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020509	TTC	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_020509	A	8	8	2542	2549	100 %	0 %	0 %	0 %	478429027
57	NC_020509	TCTT	2	8	2558	2565	0 %	75 %	0 %	25 %	478429027
58	NC_020509	T	7	7	2638	2644	0 %	100 %	0 %	0 %	478429027
59	NC_020509	T	7	7	2680	2686	0 %	100 %	0 %	0 %	478429027
60	NC_020509	GC	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	478429027
61	NC_020509	A	6	6	2829	2834	100 %	0 %	0 %	0 %	478429027
62	NC_020509	AG	3	6	2948	2953	50 %	0 %	50 %	0 %	478429027
63	NC_020509	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429027
64	NC_020509	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429027
65	NC_020509	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478429027
66	NC_020509	TGC	2	6	3218	3223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429028
67	NC_020509	GAAA	2	8	3248	3255	75 %	0 %	25 %	0 %	478429028
68	NC_020509	GAAA	2	8	3323	3330	75 %	0 %	25 %	0 %	478429028
69	NC_020509	AGTG	2	8	3344	3351	25 %	25 %	50 %	0 %	478429028
70	NC_020509	TG	3	6	3430	3435	0 %	50 %	50 %	0 %	478429028
71	NC_020509	GGT	2	6	3578	3583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429028
72	NC_020509	CAAG	2	8	3824	3831	50 %	0 %	25 %	25 %	478429028
73	NC_020509	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429028
74	NC_020509	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478429028
75	NC_020509	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020509	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020509	TGG	2	6	4179	4184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020509	ATGC	2	8	4283	4290	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020509	TGG	2	6	4299	4304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020509	GTG	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020509	ACC	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_020509	GGT	2	6	4460	4465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020509	A	7	7	4581	4587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020509	T	8	8	4601	4608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020509	AAT	2	6	4622	4627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020509	TAAA	2	8	4692	4699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020509	A	6	6	4782	4787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020509	A	7	7	4853	4859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020509	TTA	2	6	4862	4867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020509	TCC	2	6	4874	4879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_020509	TCT	2	6	4888	4893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020509	CCG	2	6	4967	4972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_020509	AAT	2	6	4984	4989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020509	TAAAA	2	10	4993	5002	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020509	ATAAA	2	10	5011	5020	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020509	T	6	6	5022	5027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020509	TTA	2	6	5068	5073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020509	ACC	2	6	5139	5144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_020509	A	8	8	5160	5167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020509	A	6	6	5178	5183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020509	A	6	6	5194	5199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020509	TCGC	2	8	5382	5389	0 %	25 %	25 %	50 %	478429029
103	NC_020509	T	6	6	5390	5395	0 %	100 %	0 %	0 %	478429029
104	NC_020509	CATT	2	8	5455	5462	25 %	50 %	0 %	25 %	478429029
105	NC_020509	ATT	2	6	5477	5482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429029
106	NC_020509	TGG	2	6	5575	5580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429029
107	NC_020509	A	6	6	5687	5692	100 %	0 %	0 %	0 %	478429029
108	NC_020509	A	6	6	5729	5734	100 %	0 %	0 %	0 %	478429029
109	NC_020509	GTT	2	6	5777	5782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
110	NC_020509	TAA	2	6	5846	5851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429029
111	NC_020509	GTTGA	2	10	5870	5879	20 %	40 %	40 %	0 %	478429029
112	NC_020509	TTA	2	6	5904	5909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429029
113	NC_020509	GTG	2	6	5973	5978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429029
114	NC_020509	GTT	2	6	5993	5998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
115	NC_020509	GTGC	2	8	6033	6040	0 %	25 %	50 %	25 %	478429029
116	NC_020509	TCT	2	6	6117	6122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429029
117	NC_020509	AGT	2	6	6205	6210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429029
118	NC_020509	TTTGA	2	10	6248	6257	20 %	60 %	20 %	0 %	478429029
119	NC_020509	GCTTGC	2	12	6279	6290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429029
120	NC_020509	AGA	2	6	6326	6331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429029
121	NC_020509	TCA	2	6	6522	6527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429029
122	NC_020509	CTG	2	6	6577	6582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429029
123	NC_020509	TGT	2	6	6637	6642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
124	NC_020509	ACC	2	6	6647	6652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429029
125	NC_020509	TTA	2	6	6669	6674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429029
126	NC_020509	CCG	2	6	6690	6695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478429029
127	NC_020509	GTTT	2	8	6708	6715	0 %	75 %	25 %	0 %	478429029
128	NC_020509	GTT	2	6	6752	6757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
129	NC_020509	TTG	2	6	6794	6799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
130	NC_020509	TGGT	2	8	6908	6915	0 %	50 %	50 %	0 %	478429029
131	NC_020509	ATCG	2	8	7091	7098	25 %	25 %	25 %	25 %	478429029
132	NC_020509	ATTG	2	8	7103	7110	25 %	50 %	25 %	0 %	478429029
133	NC_020509	A	6	6	7265	7270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020509	GA	11	22	7304	7325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020509	T	7	7	7335	7341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020509	TGT	2	6	7462	7467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020509	A	16	16	7471	7486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020509	T	9	9	7489	7497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020509	T	7	7	7515	7521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020509	TGT	2	6	7558	7563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020509	G	7	7	7637	7643	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020509	CAT	2	6	7648	7653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429030
143	NC_020509	GCC	2	6	7654	7659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478429030
144	NC_020509	C	6	6	7682	7687	0 %	0 %	0 %	100 %	478429030
145	NC_020509	TCT	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
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150	NC_020509	CAT	2	6	7911	7916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429030
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160	NC_020509	CAT	2	6	8265	8270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429030
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163	NC_020509	TTTCT	2	10	8427	8436	0 %	80 %	0 %	20 %	478429030
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170	NC_020509	GA	3	6	8685	8690	50 %	0 %	50 %	0 %	478429030
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174	NC_020509	T	6	6	8890	8895	0 %	100 %	0 %	0 %	478429030
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231	NC_020509	A	7	7	11620	11626	100 %	0 %	0 %	0 %	478429032
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256	NC_020509	AG	3	6	12649	12654	50 %	0 %	50 %	0 %	478429033
257	NC_020509	A	6	6	12716	12721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_020509	T	6	6	12743	12748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_020509	AGG	2	6	12749	12754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
260	NC_020509	TGCA	2	8	12757	12764	25 %	25 %	25 %	25 %	478429034
261	NC_020509	TGGTG	2	10	12780	12789	0 %	40 %	60 %	0 %	478429034
262	NC_020509	AGCA	2	8	12812	12819	50 %	0 %	25 %	25 %	478429034
263	NC_020509	GA	3	6	12821	12826	50 %	0 %	50 %	0 %	478429034
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271	NC_020509	T	6	6	13212	13217	0 %	100 %	0 %	0 %	478429034
272	NC_020509	AAT	2	6	13225	13230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429034
273	NC_020509	T	7	7	13276	13282	0 %	100 %	0 %	0 %	478429034
274	NC_020509	CAA	2	6	13324	13329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429034
275	NC_020509	T	6	6	13359	13364	0 %	100 %	0 %	0 %	478429034
276	NC_020509	CTA	2	6	13382	13387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429034
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402	NC_020509	GA	3	6	19596	19601	50 %	0 %	50 %	0 %	478429040
403	NC_020509	ATT	2	6	19679	19684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429040
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412	NC_020509	TTG	2	6	20310	20315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429040
413	NC_020509	T	6	6	20353	20358	0 %	100 %	0 %	0 %	478429040
414	NC_020509	AAC	2	6	20474	20479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429040
415	NC_020509	CAA	2	6	20522	20527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429040
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420	NC_020509	CCA	2	6	20775	20780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429041
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425	NC_020509	TAA	2	6	21094	21099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429041
426	NC_020509	AGGC	2	8	21118	21125	25 %	0 %	50 %	25 %	478429041
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450	NC_020509	A	7	7	22554	22560	100 %	0 %	0 %	0 %	478429042
451	NC_020509	CAA	3	9	22585	22593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429042
452	NC_020509	CTTT	2	8	22620	22627	0 %	75 %	0 %	25 %	478429042
453	NC_020509	AAG	2	6	22670	22675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429042
454	NC_020509	AAT	2	6	22731	22736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429042
455	NC_020509	ATCA	2	8	22759	22766	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
456	NC_020509	GCATG	2	10	22844	22853	20 %	20 %	40 %	20 %	478429043
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460	NC_020509	AAG	2	6	22979	22984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
461	NC_020509	CCATG	2	10	23147	23156	20 %	20 %	20 %	40 %	478429044
462	NC_020509	CTCTT	2	10	23177	23186	0 %	60 %	0 %	40 %	478429044
463	NC_020509	TGA	2	6	23378	23383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429044
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495	NC_020509	T	6	6	25108	25113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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498	NC_020509	ATTA	2	8	25229	25236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
499	NC_020509	A	15	15	25254	25268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_020509	GTT	2	6	25330	25335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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